Вот, что мне пришло в голову. Годрик узнал, что Раилаг убил короля, только в Шио. А из Шио в Империю он вернулся уже с Биарой. Так что он мог вполне "раскрыть тайны" криминального прошлого Раилага ей. Может быть, за такую болтовню тот и угодил в темницу.