В файле героя просто в список навыков надо вписать все, и будут работать. Не знаю, будут ли работать перки удачи без удачи, но все доступные навыки точно могут работать.
Однако, не знаю, как это влияет на интерес играть - я себе ставлю только 5 навыков, то количество, доступное любому герою в прокачке в нормальном режиме.
Вот скрин, как они будут оторажаться (счас приреплю)
http://c2n.me/4aiD8E6
http://c2n.me/4aiD7q0
Тут показано на примере доп навыков - можно то же с базовыми - как видишь, отображаются у героя не все, а на существах уже все