to vbn: Эту защиту должны были делать сами разработчики. В любом случае у кого нить (да даже у меня)) останется старый не измененный exe.
Можно попробовать шифровать данные во время игры, чтобы их нельзя было прочитать из оперной памяти. Это действительно можно сделать, но тогда придется менять скорее всего и формат сейвов, чтобы знать что игра велась на правильной версии. Да и работа это довольно сложна.

P.S. Те алгоритмы можно будет всегда узнать по оригинальному exe, но вот прочитать данные во время игры (как это делает светофор) не получится.