То ли так настроено, то ли ещё чего, не знаю... Некоторые миссии Владык Севера завязаны на красном грейде Ордена Порядка, который в этой игре не являлся альтернативой основному, а был новой, достаточно имбовой линейкой, только для кампаний. Видимо, форты это как-то "знают", а города нет. И как раз последнее с точки зрения прохождения кампаний может быть хуже (хотя вроде там не было момента, где это принципиально).
Если надо исправить форты, надо поковырять карты. Скорее всего, это в настройках фортов. Но я бы наоборот в кампании сделал ограничение на доступность грейдов в городах (у каждого города есть такая настройка)
PS: кстати, в миссиях Аграила с третьей по последнюю все форты полнофункциональные (улучшают и переводят), что, вобщем-то, подтверждает Вашу теорию о том, что в настройках здорово покопались.