Если открыть map-tag.xdb карты с помощью WinRAR + блокнот, там стоит специальный флаг:
falseВ случае случайных карт соответственно:trueОткрытие в редакторе меняет этот флаг с true на false, что является причиной всех бед. Правда, возможно, что там ещё где-то есть похожий флаг, но вроде бы этого было достаточно, проверьте.