Да это как раз не проблема - коэффициент перемодернизации можно настраивать в DefaultStats в 100%. Тогда при улучшении в более дорогое существо будешь доплачивать 100% разницы, никакого абуза нет. А за переход на более дешевый вариант, никто, естественно, деньги возвращать не обязан :)
Добавлено через 5 минут
Существа традиционно требуют золота, а отстройка - ресурсы+золото, и зачем стирать разницу между этими 2 аспектами экономики.